患者多先有龜頭炎病變，局部失去正常的屏障作用，繼而由腸道阿米巴病傳染而引起。局部糜爛、潰瘍、組織壞死，分泌物直接涂片可找到阿米巴原蟲。

念珠菌是一種條件致病真菌，故念珠菌性龜頭炎常繼發于糖尿病，老年消耗性疾病以及大量抗生素或激素治療之后，也可為原發性，多由配偶念珠菌陰道炎傳來，龜頭及冠狀溝可有淺紅色糜爛及薄壁膿皰。

患有念珠菌性包皮龜頭炎的患者應積極到醫院就診，做念珠菌檢查和培養，配合抗真菌藥物及抗過敏藥物，一般是可以治愈的。